Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrs1Q9CYH6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrs1Q9CYH6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms