Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChtopQ9CY57 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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