Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms