Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Snx7Q9CY18 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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