Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms