Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc17Q9CXD9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc17Q9CXD9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc17Q9CXD9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc17Q9CXD9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms