Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cnih4Q9CX13 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cnih4Q9CX13 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cnih4Q9CX13 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cnih4Q9CX13 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cnih4Q9CX13 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cnih4Q9CX13 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cnih4Q9CX13 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cnih4Q9CX13 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cnih4Q9CX13 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih4Q9CX13 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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