Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cxxc1Q9CWW7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxxc1Q9CWW7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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