Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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