Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ddx28Q9CWT6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ddx28Q9CWT6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ddx28Q9CWT6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ddx28Q9CWT6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ddx28Q9CWT6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ddx28Q9CWT6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ddx28Q9CWT6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ddx28Q9CWT6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ddx28Q9CWT6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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