Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms