Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms