Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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