Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ykt6Q9CQW1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ykt6Q9CQW1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ykt6Q9CQW1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ykt6Q9CQW1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ykt6Q9CQW1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ykt6Q9CQW1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ykt6Q9CQW1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ykt6Q9CQW1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ykt6Q9CQW1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ykt6Q9CQW1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ykt6Q9CQW1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ykt6Q9CQW1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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