Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chchd5Q9CQP3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms