Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccer1Q9CQL2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms