Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTRAFQ9CQE8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms