Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms