Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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