Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
StambpQ9CQ26 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms