Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms