Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bhlhe41Q99PV5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms