Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt23Q99PS0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms