Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn6Q99PL6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms