Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ubqln4Q99NB8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ubqln4Q99NB8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ubqln4Q99NB8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ubqln4Q99NB8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ubqln4Q99NB8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ubqln4Q99NB8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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