Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms