Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms