Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdpd3Q99LY2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms