Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms