Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms