Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms