Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms