Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrabdQ99JY4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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