Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms