Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms