Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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