Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trps1Q925H1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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