Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim7Q923T7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms