Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn1Q922Y1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms