Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms