Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms