Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usb1Q91W78 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usb1Q91W78 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usb1Q91W78 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usb1Q91W78 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usb1Q91W78 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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