Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd3Q91W18 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms