Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul7Q8VE73 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul7Q8VE73 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms