Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apol9aQ8VDU3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol9aQ8VDU3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms