Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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