Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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