Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms