Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms