Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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